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1997年6月4日，国家科技领导小组召开举行第三次会议，同意国家科委《关于加强我国重点基础研究及发展高技术产业的汇报提纲》，提出要按照中国科技工作的总体目标，制定和实施“国家重点基础研究发展规划”，加强国家战略目标导向的基础研究工作，提高中国科学技术的整体发展水平。随后由科技部组织实施了国家重点基础研究发展计划，即“973计划”。1998年6月26日，科技部正式启动国家重点基础研究发展规划项目的遴选工作，后公布国家重点基础研究发展规划首批15个立项项目。同年12月，科技部发布《国家重点基础研究发展规划项目管理暂行办法》，科技部和财政部制定了《国家重点基础研究专项经费财务管理办法》。该计划坚持“统观全局、突出重点，有所为，有所不为”为指导方针，主要任务包括：①紧紧围绕农业、能源、信息、资源环境、人口与健康、材料等领域国民经济、社会发展和科技自身发展的重大科学问题，开展多学科综合性研究，提供解决问题的理论依据和科学基础。②部署相关的、重要的、探索性强的前沿基础研究。③培养和造就适应21世纪发展需要的高科学素质、有创新能力的优秀人才。④重点建设一批高水平、能承担国家重点科技任务的科学研究基地，并形成若干跨学科的综合科学研究中心。

计划的实施，实现了国家需求导向的基础研究的部署，建立了自由探索和国家需求导向“双力驱动”的基础研究资助体系，完善了基础研究布局，带动了中国基础科学的发展。2006年落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要》的部署，基础研究领域又启动了蛋白质研究、量子调控研究、纳米研究、发育与生殖研究四个重大科学研究计划。2014年2月科技部发布973计划，重点支持农业科学等9个面向国家重大战略需求领域的基础研究，同时，围绕纳米研究等6个方向实施重大科学研究计划。2016年2月国家重点研发计划发布，“973计划”结束了历史使命。

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